PCR para Neumonía

 Tema: Estudio PCR: Neumonía

Objetivo: 

• El objetivo de este estudio fue desarrollar una reacción en cadena de la polimerasa en tiempo real (PCR) para cuantitativa detección de Streptococcus pneumoniae en muestras clínicas respiratorias.

Muestra: 

• Exudado nasofaríngeo de esputo de todos los pacientes con sospecha neumonía 
• Lavado bronco alveolar (LBA) de pacientes HAP.

Tipo de ácido nucleico:

• ADN bacteriano

Gen a amplificar:

• CbpA (166 pb)

Tipo de PCR

•  PCR a tiempo real. Se realizó una desnaturalización inicial por 95ᵒC*10s Posteriormente se realizó una extensión final por 60ᵒC*50s a 35 ciclos
  Visualización: EFO
  SENSIBILIDAD: menos de 1000 ufc/ml
  ESPECIFICIDAD:99,14%

Bibliografia:

• http://www.ajol.info/index.php/ajb/article/view/96455

Neumonía: prueba de tamizaje y una confirmatoria

Las pruebas de tamizaje son mediciones para establecer quién puede padecer cierta enfermedad y quién no, en cualquier momento de la vida de un ser humano.

Una de las pruebas más utilizadas para detectar la neumonía es la radiografía de tórax, siendo una prueba rápida y de fácil acceso por su accesible costo. Presenta una sensibilidad entre el 40% y 60% y su especificidad es mayor del 90%.

Pruebas confirmatorias:

• Gasometría arterial: para ver si está llegando suficiente oxígeno a la sangre desde los pulmones.
• Hemocultivo y Cultivo de esputo: para buscar microbios que pueden estar causando la neumonía.
• Corte sanquineo completo para verificar el conteo de glóbulos blancos.
• Topografía computarizada del tórax.
• Broncoscopia: una sonda flexible con una cámara iluminada en su extremo que se baja por los pulmones.
• Toracocentesis: extraer líquido del espacio entre el revestimiento externo de los pulmones y la pared torácica.

Referencia Bibliográfica:

• C. Rivera. Neumonía. Madrid. (actualizado en agosto del 2010, acceso en noviembre del 2016). Disponible en: http://www.dmedicina.com/enfermedades/respiratorias/neumonia.html

• D. Hadjiliadis, D. Zieve. Neumonía en adultos (extrahospitalaria). (actualizado en abril del 2014, acceso en noviembre del 2016). Disponible en: http://www.nlm.nih.gov/medlineplus/spanish/ency/article/000145.htm

Neumonía: Alteraciones Epigenómicas

Los sistemas respiratorios son sensibles a la interacción gen- ambiental que se considera fundamental en el desarrollo de neumonía. El sistema de defensa del sistema respiratorio es antioxidante e incluye enzimas metabólicas de fase II como la superóxido  dismutasa y la familia de la glutatión-S-transferasa, que son encargados de detoxificar productos de inflamación potencialmente dañinos. Se han descrito variantes genéticas de estas enzimas que aumentan el riesgo para la salud de agentes tóxicos inhalados. 

Ejemplos de fenómenos epigenéticos que aumentan el riesgo de neumonía:

• La infección que puede ser por bacterias virus y hongos.

• La contaminación del aire, tanto exterior como domiciliario, ha sido identificada como un factor potencial de riesgo.

• El hábito tabaquismo materno durante el embarazo también aumenta el riesgo en  el niño, a través de mecanismos epigenéticos. 

Referencias bibliográficas:

• Isabel Fernández. Epigenética e inmunosupresión. España. (actualizada en julio del 2010; acceso noviembre del 2016) Disponible en: http://epidemiologiamolecular.com/epigenetica-inmunosupresoin-inmunosenescencia/

Neumonía: Alteraciones en la Traducción

El Streptococcus pneumoniae sintetiza una capsula alrededor de el para contrarrestar o impedir la acción de diferentes antimicrobianos y esto representa una de las causas más importantes para la persistencia de neumonía, los genes que codifican para los polisacáridos de la capsula se encuentran organizados en un operón y en casi todos los serotipos se han encontrado que permiten la traducción de dos proteínas WZD/wze.

Es el principal agente causal de la neumonía comunitaria, en las últimas 3 décadas ha incrementado, su resistencia a los agentes terapéuticos más utilizados, como los betalactámicos, macrólidos, azálidos y fluroquinolonas.

El objetivo es encontrar un método capaz de identificar péptidos de acción inhibitoria que provoquen la deslocalización de los genes o que actúen compitiendo e interfiriendo con la interacción entre WZD y wze cuando se expresan mediante un plásmido.

Referencias bibliograficas:

• Amausi Noda. Streptococcus pneumoniae, mecanismos de resistencia antimicrobiana. Cuba (actualizado en marzo del 2011, acceso en noviembre del 2016). Disponible en: http://bvs.sld.cu/revistas/ped/vol83_3_11/ped08311.htm
• Priscilla Prado: Streptococcus pneumoniae. Chile (actualizado en enero del 2001, acceso en noviembre del 2016). Disponible en: http://www.scielo.cl/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0370-41062001000100009

Neumonía: Alteraciones en la Transcripción

La Klebsiella Pneumoniae es una bacteria causante de más de un 20% de las neumonías en neonatos y pacientes hospitalizados. Es un problema sanitario mundial por su resistencia a muchos antibióticos, según la OMS.

Los científicos han detectado la presencia de polimixinas mediante tres receptores localizados en la superficie, y la activación de estos desencadena un cambio en la transcripción de numerosos genes implicados en remoldelar la superficie de la bacteria. Se han descubierto las bases moleculares del proceso y se han encontrado que la bacteria incrementa la expresión de la cápsula y cambia la estructura de su lipopolísacarido.

Cualquier cambio generado en la transcripción genética va a producir un aumento de la resistencia bacteriana frente a varios antibióticos. Tambien vuelve a Klebsiella más resistente frente a las defensinas del pulmón, unas proteínas que son nuestra primera barrera frente a las infecciones.

Referencias Bibliográficas:

• INFOSALUS. Descubren cómo una bacteria causante de neumonías resiste al último antibiótico desarrollado para su tratamiento. Madrid. (actualizado en septiembre del 2011, acceso en octubre del 2016 ). Disponible en: http://www.infosalus.com/salud-investigacion/noticia-descubren-bacteria-causante-neumonias-resiste-ultimo-antibiotico-desarrollado-tratamiento-20110905120756.html

• CIBERER. Una bacteria que causa neumonías resiste a todos los antibióticos. Madrid. (actualizado en septiembre de 2011, acceso en octubre del 2016). Disponible en: http://www.madrimasd.org/informacionidi/noticias/noticia.asp?id=49659

Neumonía: Alteraciones en la Replicación

La replicación del virus de la neumonía (coronavirus) posee ciertas características peculiares que favorecen una alta tasa de mutación y en particular la recombinación genética. La polimerasa viral (enzima responsable de copiar el ARN para producir nuevos ARNs que formarán parte del genoma de la progenie viral) tiene la habilidad de transcribir en forma discontinua el ARN genómico 2. Esto favorece un fenómeno denominado recombinación genética, a partir del cual surgen genomas quiméricos compuestos por dos genomas de virus distintos. De esta forma, estos virus quiméricos podrían poseer un tropismo nuevo e infectar una nueva especie.

Esta alteración se produce por un problema durante la replicación del ADN para la generación de una proteína reguladora de la conductancia transmembrana (CTFR) la cual permite el paso de cloruro a través de las membranas y su ausencia tras la mutación en la replicación provoca el acumulo de sudor y moco. La enfermedad se desarrolla cuando ninguno de los dos alelos es funciona.

Dependiendo del efecto a nivel de la proteína, las mutaciones en la replicación del gen CFTR pueden dividirse en varios grupos los más importantes dos. Las mutaciones de clase I, dan como resultado ausencia de síntesis de CFRT. Las mutaciones de clase II dan como resultado proteínas CFRT que no consiguen madurar y son degradadas. 

Referencias Bibliográficas:

• Flor H. Pujol (sede web) Un nuevo coronavirus es el causante de la neumonía atípica. 2016. (Actualizada en octubre del 2016; acceso en octubre del 2016). Disponible en : http://www.ivic.gob.ve/bis/bis115/Page3.htm
• A. Salcedos Posadas (sede web) Tratado de fibrosis quistica. 2012. (Actualizada en febrero del 2012; acceso en octubre del 2016). Disponible en: http://www.neumomadrid.org/descargas/fibro_quistica_rev.pdf

¿Qué es la neumonía?

Es una infección del pulmón que puede ser causada por múltiples microorganismos como bacterias, virus y hongos que van afectar el interior de los alvéolos, lo que provoca una inflamación con daño pulmonar y se rellena de líquido y material infeccioso, lo que provoca que la respiración del afectado sea dolorosa y limita la absorción de oxígeno.

Las neumonías se clasifican según se adquieren en el día a día de una persona (neumonía adquirida en la comunidad) o en un centro sanitario (neumonía hospitalaria).

Referencias Bibliográficas:

• OMS. (sede web) Neumonía. 2015. (Actualizada en noviembre del 2015; acceso en octubre del 2016). Disponible en : http://www.who.int/mediacentre/factsheets/fs331/es/
• Olga de la Peña (sede web) Neumonía. 2015. (Actualizada en octubre del 2016; acceso en octubre del 2016). Disponible en: http://www.webconsultas.com/neumonia/neumonia-642